设置8个内设机构。具体设置及主要职责分别是：

（一）办公室。负责机关日常运转，重要事项督查督办。承担机关文秘、会务、机要、档案、保密、党内法规、政务公开、办公自动化、文件收发、目标管理等工作；承担机关来信来访接待和处理工作，指导所属单位信访稳定工作；承担有关综合性材料起草工作；负责交通行业宣传和信息工作；负责牵头人大建议、政协提案的办理工作；负责交通史志、年鉴及内部刊物的编发；负责机关后勤服务工作。（办公时间：周一至周五，9：00-12:00，14:30-18:00（节假日、公休日除外）；办公地址：石柱县南宾街道新开路44号3楼303；联系电话：023-73332261）

（二）规划科。组织拟订和综合平衡交通运输行业发展规划、交通运输体系规划和专项规划、年度计划，提出有关专项资金投资政策和项目安排建议并监督实施；承担相关交通项目建设的前期工作和后期评估工作；负责交通行业招投标监督管理工作；承担岸线使用审核有关工作；负责开展交通运输领域有关对外合作与交流；拟订国防交通保障计划、方案和应急措施并组织实施；按规定拟订和实施国防交通物资储备计划，调动国防交通物资；指导、监督和协调全县国防交通；承担交通战备日常工作。（办公时间：周一至周五，9：00-12:00，14:30-18:00（节假日、公休日除外）；办公地址：石柱县南宾街道新开路44号3楼309；联系电话：023-73329756）

（三）财务审计科。组织拟订并监督执行交通运输行业有关资金和财务管理制度；负责编制并组织实施部门预决算；负责机关和所属单位国有资产管理；指导行业投融资工作；拟订并组织实施内部审计有关制度，承担机关和所属单位落实重大决策、投资计划、财务收支、内部控制及风险管理等的审计工作；按权限组织实施有关领导干部经济责任审计工作；负责有关重点交通建设项目、专项资金等审计监督；负责督促落实审计发现问题的整改。（办公时间：周一至周五，9：00-12:00，14:30-18:00（节假日、公休日除外）；办公地址：石柱县南宾街道新开路44号5楼503；联系电话：023-73326817）

（四）组织人事科。承担机关干部人事、劳动工资、机构编制、党风廉政建设等工作；指导所属单位干部人事、劳动工资、机构编制、基层党组织建设、班子建设和党员管理、党风廉政建设、精神文明建设工作；指导协调交通运输行业人才队伍建设和培训教育工作；负责机关离退休人员管理，指导所属单位离退休人员管理工作。（办公时间：周一至周五，9：00-12:00，14:30-18:00（节假日、公休日除外）；办公地址：石柱县南宾街道新开路44号3楼315；联系电话：023-73322245）

（五）建设管理科。贯彻执行公路、水路工程、枢纽站场等交通基础设施建设相关政策、制度和技术标准；承担公路（高速公路除外）、水路工程建设市场监管，按规定对公路（高速公路除外）建设、水路工程造价、质量安全进行监督管理；负责民航项目建设协调工作；负责组织协调行业有关科技项目研究、技术引进与开发、科技成果鉴定、转化和推广应用工作；承担行业统计分析。（办公时间：周一至周五，9：00-12:00，14:30-18:00（节假日、公休日除外）；办公地址：石柱县南宾街道新开路44号3楼305；联系电话：023-73332807）

（六）行政许可服务科。负责机关行政审批制度改革，指导和规划本系统行政审批、行政许可服务工作；按照“三集中、三到位”的要求，相对集中机关有关行政审批事项的受理和审批，组织协调相关事项的论证、审查工作；负责渔业船舶检验监督管理和行业指导等工作；承担有关规范性文件合法性审查及承办交通相关行政复议、行政应诉等法律事务相关工作；负责交通系统法制宣传、教育工作；指导监督交通运输综合行政执法和队伍建设；负责机关及指导、协调所属单位社会治安综合治理工作。（办公时间：上午9：00-12:00，下午14:30-18:00（节假日除外）；办公地址：石柱县万安街道都督大道政务服务大厅4楼；联系电话：023-81501185）

（七）应急管理科。贯彻执行交通运输行业安全生产监督管理相关政策、制度和标准；组织、协调和指导行业安全生产工作；负责行业安全事故统计分析，依法组织或参与有关事故调查处理；承担所属单位安全生产的监督管理；组织推动行业应急救援体系建设，组织、协调和指导相关突发事件的应急处置工作；负责机关内部安全、保卫工作；负责机关及指导、协调所属单位消防安全工作。（办公时间：周一至周五，9：00-12:00，14:30-18:00（节假日、公休日除外）；办公地址：石柱县南宾街道新开路44号3楼307；联系电话：023-73329337）

（八）养护运输科。贯彻执行公路路政、养护、运营及道路、水路和城市公共交通运输的相关政策、制度和标准；承担公路养护市场监管工作，按规定对公路养护工程造价、质量安全进行监督管理；负责拟订下达养护经费年度计划并监督实施；承担道路和水路运政、客运市场管理有关工作；负责综合交通运输协调与衔接，组织编制和监督实施运输发展规划、运力和线网布局规划；承担协调铁路、民航运输相关工作；组织和监督实施紧急客货运输和春运工作；负责有关道路和水路运输经营资质、从业人员资质管理；承担汽车维修行业管理有关工作，指导运输场站管理；指导交通行业生态环境保护和节能减排工作。（办公时间：周一至周五，9：00-12:00，14:30-18:00（节假日、公休日除外）；办公地址：石柱县南宾街道新开路44号3楼320；联系电话：023-73326807）

机关党支部。负责机关及所属单位党群工作。